Ежегодно, с 1999года по 2003год в марте проводилась научно-практическая конференция «Проблемы стандартизации в здравоохранении». Научная программа конференции включала вопросы развития системы стандартизации в здравоохранении, разработки Протоколов ведения больных, технологии выполнения простых медицинских услуг, формуляров лекарственных средств.
В тот же период в ноябре-декабре проводился конгресс «Фармакоэкономика на рубеже тысячелетия», на котором рассматривались экономические аспекты системы управления качеством в здравоохранении, обсуждались вопросы государственного регулирования в сфере лекарственного обеспечения, развития клинико-экономического анализа в России.

С 2004года научно-практическая конференция «Проблемы стандартизации в здравоохранении» и конгресс «Фармакоэкономика на рубеже тысячелетия» были объединены.
14-16 декабря 2004 года в новом формате была проведена научно-практическая конференция «Управление качеством в здравоохранении: лицензирование, стандартизация, клинико-экономический анализ».

В конференции приняли участие представители 88 регионов Российской Федерации. Рассматривались следующие основные вопросы:

1. Лицензирование медицинской деятельности.
2. Государственная и региональная политика в области стандартизации в здравоохранении.
3. Стандартизация и программа управления качеством медицинской помощи.
4. Медицинские технологии: протоколы ведения больных, медицинские услуги.
5. Экономический анализ целесообразности применения медицинских технологий.
6. Методология и практическая реализация клинико-экономического анализа.
7. Медицина, основанная на доказательствах.